Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL38Q2WGJ6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL38Q2WGJ6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms