Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms