Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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