Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIDRQ14159 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SPIDRQ14159 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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