Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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