Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2V1Q13404 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2V1Q13404 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2V1Q13404 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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