Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTK7Q13308 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms