Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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