Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.9 ms