Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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