Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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