Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms