Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms