Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms