Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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