Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00313P59037 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms