Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms