Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms