Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms