Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPREP23469 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms