Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDHBP21912 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHBP21912 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHBP21912 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHBP21912 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms