Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DPA1P20036 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms