Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms