Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMN1P16949 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMN1P16949 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STMN1P16949 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STMN1P16949 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STMN1P16949 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms