Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH1P12830 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH1P12830 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH1P12830 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH1P12830 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms