Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms