Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM225BP0DP42 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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