Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHOP08100 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHOP08100 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHOP08100 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms