Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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