Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GOLGA8SH3BPF8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms