Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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