Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TNFSF18Q9UNG2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms