Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms