Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms