Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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