Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms