Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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