Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLVAPQ9BX97 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms