Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC28BQ9BUN5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms