Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms