Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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