Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms