Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms