Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms