Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms