Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC3Q8TF64 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms