Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF148Q8N7C7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF148Q8N7C7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms