Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms