Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms