Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNE3Q6ZMZ3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms